מערכת הביטחון הגרמנית הוא הכינוי למכלול הארגונים העוסקים בהגנה על ביטחונה של הרפובליקה הפדרלית של גרמניה, כלומר על הגנת תושביה מפני אויבים מבחוץ ומבית. לכל אחד מהגורמים במערכת הביטחון סמכויות משלו, אך לעיתים נדרשת הכרעה בשאלה מי הגורם שיתמודד עם איום ביטחוני מסוים. בין הגורמים השונים מתקיימים אינטראקציה ושיתוף פעולה, לשם מימושן של מטרות משותפות.
המשרד הפדרלי להגנת החוקה: סוכנות ביון הפנים, מופקדת על: איסוף מודיעין על מאמצים המכוונים נגד המשטר הדמוקרטי הליברלי הבסיסי, קיומה וביטחונה של הפדרציה או אחת ממדינותיה, ודו-קיום שליו בין קהילות; איסוף מודיעין נגדי; וביטחון הגנתי וסיכול טרור.
השירות לסיכול ריגול צבאי: אחראי על תחום הריגול הנגדי בתוך הבונדסוור, והוא כפוף למשרד ההגנה הפדרלי. משימותיו העיקריות של הארגון כוללות את אבטחת הכוחות הגרמניים, המחנות והמתקנים הצבאיים מפני איומים חיצוניים. פעילות זו מתמקדת בעיקר במודיעין צבאי הגנתי – קרי, איסוף מידע אסטרטגי ברמה הלאומית וכן במהלך פריסת כוחות בחו"ל. בנוסף, ה-MAD אחראי על ביצוע סיווגים ביטחוניים למתגייסים חדשים לכוחות המזוינים, ומנטר בקרבם גילויי קיצוניות או ניסיונות ריגול פוטנציאליים.
משטרה
שיירת רכבי שרד של משטרת הפלילים הפדרלית הנושאת אח"מים
סוכנות החקירה הפלילית הפדרלית של גרמניה, הכפופה במישרין למשרד הפנים הפדרלי. תחום סמכותו העיקרי של ה-BKA כולל תיאום שיתוף הפעולה בין המשטרה הפדרלית לבין משטרות המדינות (Länder), חקירת פשיעה מאורגנת בינלאומית, טרור ועבירות אחרות הנוגעות לביטחון הלאומי, וכן מתן אבטחת אישים לסמלי שלטון ולעדים פדרליים.
סוכנות אכיפת החוק הלאומית והמרכזית של הממשל הפדרלי בגרמניה. היא כפופה למשרד הפנים הפדרלי ואחראית על בקרת גבולות ביבשה ובים, אכיפת החוק בנמלי תעופה וברשתות הרכבות, וכן על הגנתם של מוסדות פדרליים.
משמש כיחידה המבצעת והפיסקאלית של הממשל הפדרלי וכחלק ממשרד האוצר הפדרלי. מטרותיו הן ניהול המסים הפדרליים, ביצוע דרישות תשלום בשם הממשלה הפדרלית ותאגידים סטטוטוריים פדרליים, פיקוח על תנועת סחורות חוצת גבולות בהתאם לאיסורים ולהגבלות, ומניעת עבודה בלתי חוקית.
מסגרת תיאום פדרלית לאכיפה ימית במימי גרמניה בים הצפוני ובים הבלטי. בניגוד למדינות אחרות, אין מדובר בגוף אחד עצמאי ובעל שרשרת פיקוד אחידה, אלא במבנה משולב המאחד מספר רשויות פדרליות הפועלות יחד תחת תיאום משותף. משימותיו העיקריות הן הגנת הגבולות, הגנת הסביבה הימית, בטיחות השיט, פיקוח על הדיג ואכיפת חוקי המכס.
ועדת קבינט שרים קבוע של הממשלה הפדרלית האמון על קביעת מדיניות הביטחון הלאומי של גרמניה. המועצה אחראית על ניסוח האסטרטגיה הביטחונית של המדינה, תוך שיתוף פעולה הדוק עם כלל גופי הממשלה הפדרלית. קנצלר גרמניה הוא יושב ראש הוועדה.
פיקוח פרלמנטרי
הפיקוח הפרלמנטרי על תחום הביטחון בגרמניה מעוגן בחוק היסוד (Grundgesetz) ומשקף את העיקרון החוקתי של שליטה אזרחית הדוקה על הכוחות המזוינים ושירותי הביטחון.
בכל הנוגע לכוחות המזוינים, הבונדסוור מוגדר בפסיקה ובחקיקה כ"צבא פרלמנטרי" (Parlamentsarmee). משמעות עיקרון זה היא שכל פריסה של כוחות מזוינים מחוץ לשטח גרמניה טעונה אישור מוקדם של הבונדסטאג. בכך הוענקה לפרלמנט סמכות פורמלית ומחייבת באישור מבצעים צבאיים בזירה הבין־לאומית, לרבות במסגרת נאט"ו או האיחוד האירופי.
ועדת ההגנה של הבונדסטאג (Verteidigungsausschuss): מבצעת את הפיקוח השוטף על מערכת הביטחון. לה מעמד ייחודי בדין הגרמני. הוועדה רשאית להפוך עצמה לוועדת חקירה, לזמן עדים, לדרוש מסמכים לרבות מסמכים מסווגים ולבחון את תקציב הביטחון ואת מדיניות משרד ההגנה.
הוועדה לפיקוח פרלמנטרי של הבונדסטאג (Parlamentarisches Kontrollgremium – PKGr): גוף ייעודי הפועל בדלתיים סגורות האחראי לפיקוח על ארגוני המודיעין הגרמנים.