אמביוויריקוטה
אמביוויריקוטה (באנגלית: Ambiviricota) היא מערכה של נגיפי RNA חד-גדיליים שמדביקים פטריות. הגנומים האלה של נגיפי RNA מכילים לפחות שתי מסגרות קריאה פתוחות לשם קריאת הגנום (open reading frames). מסגרות הקריאה קוראות רצפי RNA לא חופפים.
שם
השם נגזר מהמילה הלטינית "ambi", שמשמעותה "שניהם", בהתייחסו לאוריינטציה הכפולה, שאינה חופפת, של מסגרות הקריאה הפתוחות בגנום של חברי הטקסון שלה. הסיומת "-viricota" מציינת את סיווגה כמערכה ויראלית.[1]
מבנה
הגנומים ממוקמים בכיוונים הפוכים (אמביסנס) שאינם חופפים. "אמביסנס" (ambisense) פירושו כיווניות דו-סטרית: חלק מהגנים נקראים מצד אחד לצד שני, וחלקם – בכיוון ההפוך (כמו לקרוא מילה מהסוף להתחלה). לנגיף RNA עם אמביסנס יש לפחות שני גנים שנמצאים בכיוונים מנוגדים על גבי ה-RNA, לא חופפים, וכל אחד מהם נותן הוראה לייצור חלבון מסוים (שתי מסגרות קריאה פתוחות). מבנה האמביסנס מאפשר לנגיף לקודד חלבונים משני כיוונים שונים של אותה מולקולת RNA. בגנום של הנגיף יש לפחות שני מקטעים כאלה, כלומר הוא יודע לייצר לפחות שני חלבונים שונים.
גנומים של אמבי-וירוסים משכפלים באמצעות מנגנון מעגל מתגלגל ויוצרים מבנה דמוי מוט המכיל ריבוזימים שנמצאים גם בכיוון שבו ה-RNA מתורגם לחלבון (sense), וגם בכיוון ההפוך (antisense), כלומר יש פעילות גנטית בשני הכיוונים של הרצף. זאת בדומה לווירואידים, שהם גורמים זיהומיים קטנים ומעגליים המשתמשים גם בריבוזימים.[2]
אמבי-וירוסים מדביקים מינים שונים של פטריות, מה שהופך אותם לתחום מחקר חשוב להבנת אינטראקציות ויראליות בתוך הפונדקאים האלה.
לפחות ארבעה טקסוני פטריות עיקריים ידועים כמארחי אמבי-וירוסים: פטריות שק, פטריות בסיסה, Chytridiomycota (פטריות פרימיטיביות) ו-Glomeromycota (פטריות היוצרות יחסים סימביוטיים עם צמחים). טווח הפונדקאים הרחב הזה מצביע על כך שאמבי-וירוסים עשויים למלא תפקיד משמעותי באקולוגיה של פטריות, ולהשפיע על רבייה פטרייתית ועל אינטראקציות עם אורגניזמים אחרים.[3]
הערות שוליים
- ↑ "Taxon Details ICTV". ictv.global. נבדק ב-12 באוקטובר 2024.
{{cite web}}: (עזרה) - ↑ Kuhn, JH; Botella, L; de la Peña, M; Vainio, EJ; Krupovic, M; Lee, BD; Navarro, B; Sabanadzovic, S; Simmonds, P; Turina, M (23 ביולי 2024). "Ambiviricota, a novel ribovirian phylum for viruses with viroid-like properties". Journal of Virology. 98 (7): e0083124. doi:10.1128/jvi.00831-24. PMC 11265453. PMID 38856119.
{{cite journal}}: (עזרה); יש לבדוק את|pmc=(עזרה); יש לבדוק את|pmid=(עזרה) - ↑ Kuhn, JH; Botella, L; de la Peña, M; Vainio, EJ; Krupovic, M; Lee, BD; Navarro, B; Sabanadzovic, S; Simmonds, P; Turina, M (23 ביולי 2024). "Ambiviricota, a novel ribovirian phylum for viruses with viroid-like properties". Journal of Virology. 98 (7): e0083124. doi:10.1128/jvi.00831-24. PMC 11265453. PMID 38856119.
{{cite journal}}: (עזרה); יש לבדוק את|pmc=(עזרה); יש לבדוק את|pmid=(עזרה)Kuhn, JH; Botella, L; de la Peña, M; Vainio, EJ; Krupovic, M; Lee, BD; Navarro, B; Sabanadzovic, S; Simmonds, P; Turina, M (23 July 2024). "Ambiviricota, a novel ribovirian phylum for viruses with viroid-like properties". Journal of Virology. 98 (7): e0083124. doi:10.1128/jvi.00831-24. PMC 11265453. PMID 38856119.
אמביוויריקוטה41896569Q130693641