לדלג לתוכן

ציהור רקמות

מתוך המכלול, האנציקלופדיה היהודית

ציהור רקמות (Tissue clearing) הוא שם כולל לקבוצת שיטות כימיות המשמשות להגברת השקיפות של רקמות ביולוגיות.[1][2][3] הפיכת הרקמה לשקופה עבור אורכי גל מסוימים של אור מאפשרת גישה אופטית אל תוך הרקמה.[1] כלומר, האור יכול לעבור אל תוך הרקמה המצוהרת וממנה החוצה, וכך ניתן לראות מבנים עמוקים בתוך הרקמה בלי לחתוך אותה פיזית. קיימות שיטות רבות לציהור רקמות, ולכל אחת מהן יתרונות וחסרונות שונים.[2][4] חלק מהשיטות כלליות יחסית, ואילו אחרות מותאמות ליישומים מסוימים.[4] ציהור רקמות מועיל בדרך כלל רק בשילוב עם שיטת סימון פלואורסצנטית אחת או יותר, כגון צביעה אימונוהיסטוכימית פלואורנית, ולאחר מכן דימות, לרוב באמצעות שיטות מיקרוסקופיה של חתך אופטי(אנ').[1][5][6] ציהור רקמות יושם בתחומים רבים של המחקר הביולוגי.[7] הוא אחת הדרכים היעילות יותר לביצוע היסטולוגיה תלת־ממדית.

היסטוריה

המשנה מונה שיטות לציהור יין וחרדל המותרות בשבת:

נוֹתְנִין מַיִם עַל גַּבֵּי הַשְּׁמָרִים בִּשְׁבִיל שֶׁיֵּצָלוּ, וּמְסַנְנִין אֶת הַיַּיִן בְּסוּדָּרִין וּבִכְפִיפָה מִצְרִית, וְנוֹתְנִין בֵּיצָה בִּמְסַנֶנֶת שֶׁל חַרְדָּל (...)

הרב ישראל ליפשיץ מעיר על כך בפירושו תפארת ישראל על המשנה: ”כשמסננים משקה של חרדל. נותנים בה ביצה טרופה. וזה מותר מדאין כוונתו לברר העב מהדק. רק מתכוון להצהיר המשקה ולתקן מראיתו” (תפארת ישראל על מסכת שבת פרק כ משנה ב'). בתחילת המאה ה־20 פיתח ורנר שפלטהולץ שיטה שאפשרה לצהר רקמות גדולות,[2][8] באמצעות Wintergrünöl (מתיל סליצילט) ובנזיל בנזואט.[9] בהמשך הציעו חוקרים שונים וריאציות משלהם לשיטתו של שפלטהולץ.[8]

טוצ'ין ועמיתיו הציגו בשנת 1997 את המונח ציהור אופטי של רקמות (Tissue Optical Clearing - TOC), ובכך הוסיפו ענף חדש של ציהור רקמות שהיה הידרופילי ולא הידרופובי, בשונה משיטתו של שפלטהולץ.[1][10] בשנות ה-80 של המאה ה-20 פיתחו אנדרו מארי ומארק קירשנר תהליך דו־שלבי, שבו הרקמות עברו תחילה ייבוש באמצעות כוהל ולאחר מכן צוהרו על ידי השריה בתערובת של בנזיל אלכוהול ובנזיל בנזואט (BABB). את השיטה הם שילבו עם מיקרוסקופיית יריעת אור,[11][2][3] והיא נותרה עד היום השיטה בעלת יעילות הציהור הגבוהה ביותר, ללא תלות בשלב מקדים כלשהו של עיבוד הרקמה.[12] במקרים הקיצוניים ביותר היא מאפשרת לצהר עכבר מומת שלם ואף מוח אנושי שלם.[13]

בשנת 2024 דיווחו הונג, ברונגרסמה ואו כי זילוף תמיסה בעלת ריכוז גבוה של צבע המאכל טרטרזין מאפשר להגביר באופן זמני והפיך את השקיפות האופטית של רקמות ביולוגיות מסוימות, לרבות העור, בעכברים חיים.[14][15][16] המחברים ייחסו את האפקט לבליעה החזקה של טרטרזין בתחום הכחול של הספקטרום הנראה ולשינוי של מקדם השבירה באורכי גל ארוכים יותר, בהתאם ליחסי קרמרס–קרוניג. בעקבות הפרסום שוחזרו והורחבו הממצאים באופן בלתי תלוי בכמה מעבדות ובכמה מחקרים מאוחרים יותר.[17][18][19] בפרט, גישת ציהור אופטי זו בחיים יושמה בכמה מעבדות בלתי תלויות לשיפור עומק הדימות בשיטות כגון טומוגרפיה אופטית קוהרנטית ודימות פוטואקוסטי.[17][19][20][21][22][23] בשנת 2025 הדגים ולרי ו' טוצ'ין, מחלוצי ציהור הרקמות ההידרופילי, כי טרטרזין יכול להפוך את הגולגולת לשקופה יותר בעכברים חיים, ובכך לאפשר דימות כתמים בלייזר (אנ') דרך הגולגולת של זרימת הדם בקליפת המוח בזמן אמת.[18] נוסף על כך, כמה מעבדות אחרות הדגימו את התועלת של טרטרזין לאפשר חישת ראמאן (אנ') בעומק רקמה[24] ומיקרוסקופיית דימות זמן חיים פלואורסצנטי (אנ').[25] לצד טרטרזין, כמה מולקולות צבע בולעות אחרות, ובהן חומרי ניגוד שאושרו על ידי ה־FDA כגון פלואורסין וירוק אינדוציאנין, הוסבו גם הן לשמש כחומרים מצהרים אופטיים בחיים.[26][27][28] תצפית זו מצביעה על כך שהעיקרון הפיזיקלי העומד בבסיס ציהור אופטי בעזרת צבעים אינו מוגבל למולקולה יחידה, ושאפשר להסב מולקולות צבע שונות לשמש כחומרים מצהרים.

עקרונות

מקובל לחשוב שעכירות רקמה נגרמת מפיזור אור עקב הטרוגניות במקדמי השבירה - לרוב כתוצאה מהשוני במקדם השבירה בין שומנים וחלבונים המרכיבים את קרום התא לבין התווך המימי התוך-תאי והחוץ-תאי.[1][4][5] שיטות לציהור רקמות יוצרות הומוגניזציה כימית של מקדמי השבירה, והתוצאה היא רקמה שקופה כמעט לחלוטין.[4][6]

סיווג

אף שקיימים כמה שמות מחלקה לשיטות ציהור רקמות, כולן מסווגות לפי מצבה הסופי של הרקמה בסוף תהליך הציהור.[1] אלה כוללות שיטות ציהור הידרופוביות,[1][2][6] המכונות גם שיטות אורגניות,[3] שיטות מבוססות ממסים,[4][5] שיטות מבוססות ממסים אורגניים,[29][30] או שיטות ציהור מבוססות דהידרציה;[31] שיטות ציהור הידרופיליות,[1][2][6] המכונות גם שיטות מבוססות תמיסה מימית[5][29] או מבוססות מים;[31] וכן שיטות ציהור מבוססות הידרוג'ל.[2][1]

סימון

לשיטות שונות לציהור רקמות יש התאמה משתנה לשיטות שונות של סימון פלואורני.[1][5][6] חלקן מתאימות יותר לסימון באמצעות חלבון פלואורני המבוטא גנטית,[1][5] ואילו אחרות מתאימות לסמנים פלואורניים בוהקים המוחדרים מבחוץ, כגון סימון אימונולוגי וסימון בצבעים כימיים.[1][5] האפשרות השנייה כללית יותר וניתנת ליישום בכל הרקמות, ובמיוחד ברקמות אדם.[32]

דימות

לאחר הציהור והסימון, הרקמות מדומות בדרך כלל באמצעות מיקרוסקופיה קונפוקלית,[29][30][31] מיקרוסקופיה דו־פוטונית,[1][5][29] או אחת מן הגרסאות הרבות של מיקרוסקופיית יריעת אור (אנ').[7][29][30] שיטות אחרות, נפוצות פחות, כוללות טומוגרפיית היטלים אופטיים(אנ') [1][5] ופיזור ראמאן מאולץ.[5][7][29] כל עוד הרקמה מאפשרת מעבר אור ללא חסימה, הרזולוציה האופטית מוגבלת ביסודה על ידי גבול העקיפה של אבה.

נתונים

ציהור רקמות הוא אחת הדרכים היעילות יותר לאפשר דימות תלת־ממדי של רקמות, ולכן הוא מייצר נפחים עצומים של נתונים מורכבים, הדורשים חומרה ותוכנה חישוביות חזקות לאחסון, עיבוד, ניתוח והמחשה.[1][6][31] מוח עכבר יחיד יכול לייצר טרה־בתים של נתונים.[2][6][31] קיימות תוכנות מסחריות ותוכנות קוד פתוח העונות על צורך זה; חלקן הותאמו מפתרונות לתמונות דו־ממדיות וחלקן תוכננו במיוחד לתמונות התלת־ממדיות המופקות מדימות של רקמות מצווהרות.[1][29][30]

יישומים

ציהור רקמות משמש בין היתר לדימות מערכת העצבים,[1][2][3][4][5][6][7][29][33][34] עצמות, לרבות שיניים,[7][29][30][35][36][37] שרירי שלד,[7][37][38] לב וכלי דם,[7][29][39] איברי מערכת העיכול,[7][40] איברי מערכת השתן והמין,[7][29][41] עור,[7][42] בקשרי לימפה,[7] בלוטות חלב,[7] ריאות,[7] עיניים,[7] גידולים ממאירים,[7][29] ורקמות שומן.[7][29] ציהור של גוף שלם נפוץ פחות, אך בוצע בבעלי חיים קטנים, ובהם מכרסמים.[1][6][7] ציהור רקמות יושם גם ברקמות סרטן אנושיות.[43][44] בשיטות מסוימות יש לבצע דה-קלציפיקציה של רקמת עצם כדי להסיר גבישי הידרוקסילאפטיט המפזרים אור, ולהותיר מטריצה חוץ-תאית חלבונית המתאימה לציהור.[45][46]

לקריאה נוספת

הערות שוליים

  1. ^ 1.00 1.01 1.02 1.03 1.04 1.05 1.06 1.07 1.08 1.09 1.10 1.11 1.12 1.13 1.14 1.15 1.16 1.17 Zhao J, Lai HM, Qi Y, He D, Sun H (בינואר 2021). "Current Status of Tissue Clearing and the Path Forward in Neuroscience". ACS Chemical Neuroscience. 12 (1): 5–29. doi:10.1021/acschemneuro.0c00563. PMID 33326739. S2CID 229300600. {{cite journal}}: (עזרה)
  2. ^ 2.0 2.1 2.2 2.3 2.4 2.5 2.6 2.7 2.8 Ueda HR, Dodt HU, Osten P, Economo MN, Chandrashekar J, Keller PJ (במאי 2020). "Whole-Brain Profiling of Cells and Circuits in Mammals by Tissue Clearing and Light-Sheet Microscopy". Neuron. 106 (3): 369–387. doi:10.1016/j.neuron.2020.03.004. PMC 7213014. PMID 32380050. {{cite journal}}: (עזרה)
  3. ^ 3.0 3.1 3.2 3.3 Vigouroux RJ, Belle M, Chédotal A (ביולי 2017). "Neuroscience in the third dimension: shedding new light on the brain with tissue clearing". Molecular Brain. 10 (1). doi:10.1186/s13041-017-0314-y. PMC 5520295. PMID 28728585. {{cite journal}}: (עזרה)
  4. ^ 4.0 4.1 4.2 4.3 4.4 4.5 Porter DD, Morton PD (בינואר 2020). "Clearing techniques for visualizing the nervous system in development, injury, and disease". Journal of Neuroscience Methods. 334. doi:10.1016/j.jneumeth.2020.108594. PMC 10674098. PMID 31945400. S2CID 210430342. {{cite journal}}: (עזרה)
  5. ^ 5.00 5.01 5.02 5.03 5.04 5.05 5.06 5.07 5.08 5.09 5.10 Tian T, Li X (בנובמבר 2020). "Applications of tissue clearing in the spinal cord". The European Journal of Neuroscience. 52 (9): 4019–4036. doi:10.1111/ejn.14938. PMID 32794596. S2CID 221121163. {{cite journal}}: (עזרה)
  6. ^ 6.0 6.1 6.2 6.3 6.4 6.5 6.6 6.7 6.8 Ueda HR, Ertürk A, Chung K, Gradinaru V, Chédotal A, Tomancak P, Keller PJ (בפברואר 2020). "Tissue clearing and its applications in neuroscience". Nature Reviews. Neuroscience. 21 (2): 61–79. doi:10.1038/s41583-019-0250-1. PMC 8121164. PMID 31896771. S2CID 209528204. {{cite journal}}: (עזרה)
  7. ^ 7.00 7.01 7.02 7.03 7.04 7.05 7.06 7.07 7.08 7.09 7.10 7.11 7.12 7.13 7.14 7.15 7.16 Gómez-Gaviro MV, Sanderson D, Ripoll J, Desco M (באוגוסט 2020). "Biomedical Applications of Tissue Clearing and Three-Dimensional Imaging in Health and Disease". iScience (באנגלית). 23 (8). Bibcode:2020iSci...23j1432G. doi:10.1016/j.isci.2020.101432. PMC 7452225. PMID 32805648. {{cite journal}}: (עזרה)
  8. ^ 8.0 8.1 Azaripour A, Lagerweij T, Scharfbillig C, Jadczak AE, Willershausen B, Van Noorden CJ (באוגוסט 2016). "A survey of clearing techniques for 3D imaging of tissues with special reference to connective tissue". Progress in Histochemistry and Cytochemistry. 51 (2): 9–23. doi:10.1016/j.proghi.2016.04.001. PMID 27142295. {{cite journal}}: (עזרה)
  9. Spalteholz W (1914). Über das Durchsichtigmachen von menschlichen und tierischen Präparaten und seine theoretischen Bedingungen, nebst Anhang: Über Knochenfärbung. Leipzig: S. Hirzel.
  10. Tuchin VV, Maksimova IL, Zimnyakov DA, Kon IL, Mavlyutov AH, Mishin AA (באוקטובר 1997). "Light propagation in tissues with controlled optical properties". Journal of Biomedical Optics. 2 (4): 401–17. Bibcode:1997JBO.....2..401T. doi:10.1117/12.281502. PMID 23014964. {{cite journal}}: (עזרה)
  11. Dent; Polson; Klymkowsky (1989). "A whole-mount immunocytochemical analysis of the expression of the intermediate filament protein vimentin in Xenopus". Development. 105 (1): 61–74. doi:10.1242/dev.105.1.61. PMID 2806118.
  12. Pan, Chenchen; Cai, Ruiyao; Quacquarelli, Francesca Paola; Ghasemigharagoz, Alireza; Lourbopoulos, Athanasios; Matryba, Paweł; Plesnila, Nikolaus; Dichgans, Martin; Hellal, Farida; Ertürk, Ali (2016). "Shrinkage-mediated imaging of entire organs and organisms using uDISCO". Nature Methods. 13 (10): 859–867. doi:10.1038/nmeth.3964. PMID 27548807.
  13. Zhao, Shan; Mihail Ivilinov, Todorov; Ruiyao, Cai; Rami, AI -Maskari; Hanno, Steinke; Elisabeth, Kemter; Hongcheng, Mai; Zhouyi, Rong; Martin, Warmer; Karen, Stanic; Oliver, Schoppe; Johannes Christian, Paetzold; Benno, Gesierich; Milagros N., Wong; Tobias B., Huber; Marco, Duering; Oliver Thomas, Bruns; Bjoern, Menze; Jan, Lipfert (2020). "Cellular and Molecular Probing of Intact Human Organs". Cell. 2020 (4): 796–812.e19. doi:10.1016/j.cell.2020.01.030. PMC 7557154. PMID 32059778.
  14. Ou, Zihao; Duh, Yi-Shiou; Rommelfanger, Nicholas J.; Keck, Carl H. C.; Jiang, Shan; Brinson, Kenneth; Zhao, Su; Schmidt, Elizabeth L.; Wu, Xiang; Yang, Fan; Cai, Betty; Cui, Han; Qi, Wei; Wu, Shifu; Tantry, Adarsh (2024-09-06). "Achieving optical transparency in live animals with absorbing molecules". Science. 385 (6713). Bibcode:2024Sci...385m6869O. doi:10.1126/science.adm6869. PMC 11931656. PMID 39236186.
  15. Keck, Carl H. C.; Schmidt, Elizabeth Lea; Zhao, Su; Liu, Zhongyu; Zhang, Ling-Yi; Cui, Miao; Chen, Xiaoyu; Wang, Chonghe; Cui, Han; Brongersma, Mark L.; Hong, Guosong (2025-05-13). "Achieving transient and reversible optical transparency in live mice with tartrazine". Nature Protocols (באנגלית). 21 (1): 319–346. doi:10.1038/s41596-025-01187-z. ISSN 1750-2799. PMID 40360854.
  16. Shabbir, Muhammad Waqas; Asante-Asare, David; Phillips, Matthew; Ou, Zihao (2025-07-11). "Transient Optical Clearing Using Absorbing Molecules for Ex Vivo and In Vivo Imaging". Journal of Visualized Experiments (באנגלית) (221). doi:10.3791/68629. ISSN 1940-087X. PMID 40720350.
  17. ^ 17.0 17.1 Miller, David A.; Xu, Yirui; Highland, Robert; Nguyen, Van Tu; Brown, William J.; Hong, Guosong; Yao, Junjie; Wax, Adam (2025-01-20). "Enhanced penetration depth in optical coherence tomography and photoacoustic microscopy in vivo enabled by absorbing dye molecules". Optica (באנגלית). 12 (1): 24–30. Bibcode:2025Optic..12...24M. doi:10.1364/OPTICA.546779. ISSN 2334-2536. PMC 12858289. PMID 41625956.
  18. ^ 18.0 18.1 Surkov, Y.; Timoshina, P.; Uvakin, I.; Shushunova, N.; Konovalov, A.; Kozlov, I.; Piavchenko, G.; Telyshev, D.; Meglinski, I.; Kuznetsov, S.; Tuchin, V. (2025-10-16). "Computer-guided optical clearing for transcranial laser speckle imaging of cortical blood flow through synergistic tartrazine-induced cranial bone transparency". Journal of Innovative Optical Health Sciences 2. doi:10.1142/S1793545825400024. ISSN 1793-5458.
  19. ^ 19.0 19.1 Zuo, Tianxiang; Tao, Chao; Liu, Xiaojun (2025-04-01). "Absorbing molecules as optical clearing agents improve the resolution and sensitivity of photoacoustic microscopy". Optics Letters (באנגלית). 50 (7): 2282–2285. Bibcode:2025OptL...50.2282Z. doi:10.1364/OL.555723. ISSN 0146-9592. PMID 40167701.
  20. Jia, Conger; Zhang, Zhiling; Shen, Yuecheng; Hou, Wanli; Zhao, Jiayu; Luo, Jiawei; Chen, Haoran; Qi, Dalong; Yao, Yunhua; Deng, Lianzhong; Ma, Hongmei; Sun, Zhenrong; Zhang, Shian (2025-06-01). "Tartrazine-enabled optical clearing for in vivo optical resolution photoacoustic microscopy". Biomedical Optics Express (באנגלית). 16 (6): 2504–2515. doi:10.1364/BOE.565643. ISSN 2156-7085. PMC 12265485. PMID 40677379.
  21. Xu, Maoyuan; Yang, Bingqian; Song, Shen; Xu, Tianpeng; Yao, Jinyu; Liu, Yuehao; Cui, Yaoyao; Zhang, Yachao (2025-10-01). "Multi-wavelength photoacoustic microscopy enhanced by the high-sensitivity probe and reversible tissue transparent molecules". Photonics Research (באנגלית). 13 (10): 2757. doi:10.1364/PRJ.565972. ISSN 2327-9125.
  22. Liang, Yilin; Meng, Xiaochen; Wang, Chongyang; Ma, Jiawei; Zhang, Xuanye; Fan, Fan; Zhu, Jiang (בספטמבר 2025). "Optical Coherence Tomography and Angiography Image Enhancement Using Optical Clearing Agent Tartrazine". Journal of Biophotonics (באנגלית). 19 (1). doi:10.1002/jbio.202500297. ISSN 1864-063X. PMID 40890078. {{cite journal}}: (עזרה)
  23. Narawane, Amit; Trout, Robert; Viehland, Christian; Kuo, Anthony N.; Vajzovic, Lejla; Dhalla, Al-Hafeez; Toth, Cynthia A. (2024-12-09). "Optical clearing with tartrazine enables deep transscleral imaging with optical coherence tomography". Journal of Biomedical Optics. 29 (12). Bibcode:2024JBO....29l0501N. doi:10.1117/1.JBO.29.12.120501. ISSN 1083-3668. PMC 11635458. PMID 39669907.
  24. Lee, Michael Ka Ho; Mizushima, Kenta; Zheng, Peng; Tanwar, Swati; Gupta, Anoushka; Fujita, Katsumasa; Barman, Ishan (2025-10-24). "Spectrally Silent and Optically Transparent: Clear-SiR for Deep Raman Biomolecular Sensing". ACS Sensors. 10 (10): 7702–7711. Bibcode:2025ACSSe..10.7702L. doi:10.1021/acssensors.5c02046. PMC 12993836. PMID 41024637.
  25. Yuan, Nanxue; Ragab, Saif; Chavez, Luis; Pandey, Vikas; Intes, Xavier (2025-12-15). "Evaluating tartrazine as an optical clearing agent for fluorescence lifetime imaging". Optics Letters (באנגלית). 50 (24): 7588–7591. Bibcode:2025OptL...50.7588Y. doi:10.1364/OL.579040. ISSN 0146-9592. PMID 41396940.
  26. Trout, Robert M; Narawane, Amit; Viehland, Christian; Ownagh, Vahid; Draelos, Mark; Dhalla, Al-Hafeez; Kuo, Anthony; Toth, Cynthia (2026). "Optical Coherence Tomography with Fluorescein Optical Clearing for Transscleral Image Guidance". International Journal of Translational Medicine (באנגלית). 6: 7. bioRxiv 10.1101/2025.07.01.661162. doi:10.3390/ijtm6010007.
  27. Lu, Kechao; Xu, Yirui; Miller, David A.; Wang, Wan; Gupta, Deven; Yao, Junjie; Wax, Adam (2025-09-01). "Indocyanine green (ICG) enhances penetration of 1300 nm optical coherence tomography imaging for in vivo murine skin". Optics Letters (באנגלית). 50 (17): 5226–5229. Bibcode:2025OptL...50.5226L. doi:10.1364/OL.569764. ISSN 0146-9592. PMC 12848760. PMID 40882048.
  28. Keck, Carl H. C.; Schmidt, Elizabeth L.; Roth, Richard H.; Floyd, Brendan M.; Tsai, Andy P.; Garcia, Hassler B.; Cui, Miao; Chen, Xiaoyu; Wang, Chonghe; Park, Andrew; Zhao, Su; Liao, Pinyu A.; Casey, Kerriann M.; Reineking, Wencke; Cai (2025-09-02). "Color-neutral and reversible tissue transparency enables longitudinal deep-tissue imaging in live mice". Proceedings of the National Academy of Sciences. 122 (35). Bibcode:2025PNAS..12204264K. doi:10.1073/pnas.2504264122. PMC 12415250. PMID 40857313.
  29. ^ 29.00 29.01 29.02 29.03 29.04 29.05 29.06 29.07 29.08 29.09 29.10 29.11 29.12 Tian T, Yang Z, Li X (בפברואר 2021). "Tissue clearing technique: Recent progress and biomedical applications". Journal of Anatomy. 238 (2): 489–507. doi:10.1111/joa.13309. PMC 7812135. PMID 32939792. {{cite journal}}: (עזרה)
  30. ^ 30.0 30.1 30.2 30.3 30.4 Jing D, Yi Y, Luo W, Zhang S, Yuan Q, Wang J, et al. (ביוני 2019). "Tissue Clearing and Its Application to Bone and Dental Tissues". Journal of Dental Research. 98 (6): 621–631. doi:10.1177/0022034519844510. PMC 6535919. PMID 31009584. {{cite journal}}: (עזרה)
  31. ^ 31.0 31.1 31.2 31.3 31.4 Watson AM, Watkins SC (ביולי 2019). "Massive volumetric imaging of cleared tissue: The necessary tools to be successful". The International Journal of Biochemistry & Cell Biology. 112: 76–78. doi:10.1016/j.biocel.2019.05.007. PMID 31085331. S2CID 155088859. {{cite journal}}: (עזרה)
  32. Yau, Chun Ngo; Hei Ming, Lai (2023). "Principles of deep immunohistochemistry for 3D histology". Cell Reports Methods. 3 (5). doi:10.1016/j.crmeth.2023.100458. PMC 10261851. PMID 37323568.
  33. Kumar V, Krolewski DM, Hebda-Bauer EK, Parsegian A, Martin B, Foltz M, et al. (במרץ 2021). "Optimization and evaluation of fluorescence in situ hybridization chain reaction in cleared fresh-frozen brain tissues". Brain Structure & Function. 226 (2): 481–499. doi:10.1007/s00429-020-02194-4. PMC 7962668. PMID 33386994. {{cite journal}}: (עזרה)
  34. Dai Z, Sun Y, Zhao X, Pu X (ביוני 2020). "Novel imaging and related techniques for studies of diseases of the central nervous system: a review". Cell and Tissue Research. 380 (3): 415–424. doi:10.1007/s00441-020-03183-z. PMID 32072308. S2CID 211170939. {{cite journal}}: (עזרה)
  35. Greenbaum A, Chan KY, Dobreva T, Brown D, Balani DH, Boyce R, et al. (באפריל 2017). "Bone CLARITY: Clearing, imaging, and computational analysis of osteoprogenitors within intact bone marrow". Science Translational Medicine. 9 (387). doi:10.1126/scitranslmed.aah6518. PMID 28446689. S2CID 8799170. {{cite journal}}: (עזרה)
  36. Treweek JB, Beres A, Johnson N, Greenbaum A (2021). "Phenotyping Intact Mouse Bones Using Bone CLARITY". In Hilton MJ (ed.). Skeletal Development and Repair. Methods in Molecular Biology. Vol. 2230. New York, NY: Springer US. pp. 217–230. doi:10.1007/978-1-0716-1028-2_13. ISBN 978-1-0716-1028-2. PMID 33197017. S2CID 226988513.
  37. ^ 37.0 37.1 Wang HM, Khoradmehr A, Tamadon A, Velez E, Nabipour I, Jokar N, et al. (במרץ 2020). "Imaging of the muscle and bone from benchtop to bedside". European Review for Medical and Pharmacological Sciences. 24 (6): 3254–3266. doi:10.26355/eurrev_202003_20693. PMID 32271443. S2CID 215602325. {{cite journal}}: (עזרה)
  38. Li Y, Xu J, Zhu J, Yu T, Zhu D (בינואר 2020). "Three-dimensional visualization of intramuscular innervation in intact adult skeletal muscle by a modified iDISCO method". Neurophotonics. 7 (1). doi:10.1117/1.NPh.7.1.015003. PMC 6977403. PMID 32016132. {{cite journal}}: (עזרה)
  39. Olianti C, Costantini I, Giardini F, Lazzeri E, Crocini C, Ferrantini C, et al. (באוגוסט 2020). "3D imaging and morphometry of the heart capillary system in spontaneously hypertensive rats and normotensive controls". Scientific Reports. 10 (1). Bibcode:2020NatSR..1014276O. doi:10.1038/s41598-020-71174-9. PMC 7459314. PMID 32868776. {{cite journal}}: (עזרה)
  40. Liu CY, Polk DB (ביולי 2020). "Cellular maps of gastrointestinal organs: getting the most from tissue clearing". American Journal of Physiology. Gastrointestinal and Liver Physiology. 319 (1): G1 – G10. doi:10.1152/ajpgi.00075.2020. PMC 7468759. PMID 32421359. {{cite journal}}: (עזרה)
  41. Isaacson D, McCreedy D, Calvert M, Shen J, Sinclair A, Cao M, et al. (2020-01-01). "Imaging the developing human external and internal urogenital organs with light sheet fluorescence microscopy". Differentiation; Research in Biological Diversity. 111: 12–21. doi:10.1016/j.diff.2019.09.006. PMID 31634681. S2CID 204833112.
  42. Fernandez E, Marull-Tufeu S (בספטמבר 2019). "3D imaging of human epidermis micromorphology by combining fluorescent dye, optical clearing and confocal microscopy". Skin Research and Technology. 25 (5): 735–742. doi:10.1111/srt.12710. PMID 31074525. S2CID 149445451. {{cite journal}}: (עזרה)
  43. Tanaka N, Kanatani S, Tomer R, Sahlgren C, Kronqvist P, Kaczynska D, Louhivuori L, Kis L, Lindh C, Mitura P, Stepulak A, Corvigno S, Hartman J, Micke P, Mezheyeuski A, Strell C, Carlson JW, Fernández Moro C, Dahlstrand H, Östman A, Matsumoto K, Wiklund P, Oya M, Miyakawa A, Deisseroth K, Uhlén P (באוקטובר 2017). "Whole-tissue biopsy phenotyping of three-dimensional tumours reveals patterns of cancer heterogeneity". Nature Biomedical Engineering (באנגלית). 1 (10): 796–806. doi:10.1038/s41551-017-0139-0. PMID 31015588. S2CID 256713371. {{cite journal}}: (עזרה)
  44. Tanaka N, Kanatani S, Kaczynska D, Fukumoto K, Louhivuori L, Mizutani T, Kopper O, Kronqvist P, Robertson S, Lindh C, Kis L, Pronk R, Niwa N, Matsumoto K, Oya M, Miyakawa A, Falk A, Hartman J, Sahlgren C, Clevers H, Uhlén P (בספטמבר 2020). "Three-dimensional single-cell imaging for the analysis of RNA and protein expression in intact tumour biopsies". Nature Biomedical Engineering (באנגלית). 4 (9): 875–888. doi:10.1038/s41551-020-0576-z. PMID 32601394. S2CID 256704785. {{cite journal}}: (עזרה)
  45. Zhao J, Lai HM, Qi Y, He D, Sun H (בינואר 2021). "Current Status of Tissue Clearing and the Path Forward in Neuroscience". ACS Chemical Neuroscience. 12 (1): 5–29. doi:10.1021/acschemneuro.0c00563. PMID 33326739. S2CID 229300600. {{cite journal}}: (עזרה)
  46. Vigouroux RJ, Belle M, Chédotal A (ביולי 2017). "Neuroscience in the third dimension: shedding new light on the brain with tissue clearing". Molecular Brain. 10 (1). doi:10.1186/s13041-017-0314-y. PMC 5520295. PMID 28728585. {{cite journal}}: (עזרה)

ציהור רקמות43328229Q106652972